Tiểu huyện được lập năm 1914 từ 17 tambon của các huyện Ban Pong, Photharam và Damnoen Saduak. Năm 1917, đơn vị này được nâng cấp thành huyện. Ban đầu, trụ sở tạm của huyện nằm ở tòa nhà của Wat Hua Pho ở tambon Hua Pho. Do đó đầu tiên huyện được đặt tên là Hua Pho, nhưng đã được đổi tên thành Bang Phae năm 1939,[1] khi trụ sở huyện năm ở tambon Bang Phae từ năm 1918 tại bờ đông của kênh Bang Phae.